Trong “Natsume’s Friend’s Book ~ Yi Yukura ~ SP”, Natsume, cậu bé vốn dĩ sống bận rộn giữa hai thế giới con người và quái vật, lại vô tình gặp lại Yuki, người bạn học cũ đã cách trở bao nhiêu năm. Ngay lập tức, những ký ức cay đắng về lũ quái vật và mối nguy hiểm về tên lửa Bông sen hiện lên trong tâm trí Natsume. Ngay giữa lúc ông hoàng quỷ dữ chưa kịp nổi lên, Natsume tình cờ gặp Tsumura, một nữ Yokai xuất hiện trong ký ức của một con quái vật đã được trả lại tên. Tsumura vui mừng chia sẻ rằng Reiko, người bà nội ruột của Natsume, hiện đang sống yên bình với đứa con trai duy nhất của mình là Mukuo. Giao tiếp với họ đã giúp Natsume bình tĩnh lại. Tuy nhiên, thị trấn nơi hai mẹ con Reiko sống bỗng chốc chìm trong bí ẩn, hiện hữu những con quái vật bí ẩn đang rình rập.

Chuyến đi điều tra vụ việc kết thúc, trên đường trở về, “hạt giống quỷ” ký sinh trên cơ thể cậu Mèo bất ngờ mọc thành cây to, đơm hoa kết trái qua đêm trong sân của gia đình Fujiwara, và lý do nào đó, anh mèo lại thích ăn quả na mới nảy mầm, quả na lại chẻ làm ba. Cùng lúc đó, một câu hỏi ám ảnh Natsume nâng cao niêm trong người, liệu lần này cậu bé có trở về với cuộc sống bình thường hay phải đối mặt với vụ án bí ẩn chưa từng thấy?