Vua Trò Chơi Phần 1 đưa khán giả vào thế giới ma thuật, kỳ ảo của Duel Monsters.
Cốt truyện xoay quanh cậu bé Yugi Mutou, một học sinh trung học trung bình nhưng sở hữu một bí mật đặc biệt: hắn ta là người sở hữu trò Chơi Ngàn Năm, một truyền thuyết cổ xưa. Khi Yugi hoàn thành trò chơi, Yami Yugi, một linh hồn Pharaoh Ai Cập cổ đại từ 3000 năm trước, đã được hồi sinh và xuất hiện. Yami Yugi là nhân cách thứ hai của Yugi, giúp cậu bé vượt qua những thử thách khó khăn trong cuộc sống, đặc biệt là trong cuộc chiến duels với những kẻ ương ngạnh. Điều kiện làm nền tảng cho mọt hành trình phiêu lưu nguy hiểm, đầy những bí mật và xung đột, bắt đầu từ lúc Yugi đối đầu với Bakura, nguyền khóa mang trong tay 3 lá bài bị nguyền rủa là bảo vật ngàn năm. Sau khi hạ gục Pegasus trên hòn đảo bí ẩn, Yami Yugi được kẻ lật bản thể do Pegasus cất lên chỉ ra sự tà ác ẩn chôn trong các bảo vật và đồng thời thèm muốn truy tìm về quá khứ của mình. Trải qua bao trận đấu, giành chiến thắng trước Yami Marik, Yugi và Yami Yugi sở hữu 3 lá bài thần linh và bắt đầu hành trình đi về quá khứ. Ở đó, Yami Yugi, hay chính xác là Pharaoh thứ 18 của Ai Cập, Atem, đã hóa thân thành người anh hùng chống lại quân thù và gia tốc mạch nguồn gốc của những thế lực hắc ám. Trong trận chiến kinh hoàng với quân đoàn quân của The Thief Bakura, chúng ta chứng kiến cảnh Shadi, người thân cận của Bảo Khấu Ai Cập, hi sinh cùng với Kalim, để bảo vệ Yugi.
Sau đó, chính Yugi và các bạn đồng hành đến kịp thời, mang đến cho Yami Yugi tên là Atem. Tương tự như thế, Hasan, hay Shadel, bị Zorc, chúa tể bóng tối, tiêu diệt. Trong lúc Zork trỗi dậy, Atem gọi tên mình, hồn phượng hoàng thức tỉnh, ba vị thần trong xấp bài của Yugi hóa thân thành vị thần Horakhty, đánh tan Zorc. Sau khi quay về hoàng cung tìm Seto, Yami Yugi tiếp tục trận đấu cuối cùng với Seto, người đã bị Akunadin – một vị thần bóng tối – điều khiển. Kisara, tình nhân kiếp trước của Seto, xuất hiện cùng với sức mạnh kinh khủng, tiêu diệt Akunadin và cứu thế giới. Sau tất cả, Atem nhường ngôi cho Seto và ra đi, khép lại một chương mới trong cuộc đời của mình. Cuối cùng, Yugi và Yami Yugi phải tham gia vào trận đấu quyết định – Cuộc chiến nghi thức.
Mặc dù kết quả đã được sắp đặt trước đây, nhưng trận đấu này là dịp để chúng ta cảm nhận được hết tình cảm, sự hy sinh và ham muốn muốn vươn lên của mỗi nhân vật..
