Thời kỳ dân quốc, bến cảng Tân Môn luôn là nơi náo nhiệt, tấp nập, nhưng cũng ẩn chứa nhiều mâu thuẫn và nguy hiểm. Hai phe phái Tào vận và bang Thanh Long đã vĩnh viễn chìm trong chiến tranh giành giật địa bàn và quyền lợi. Tần Phàm, một người có lòng chính trực, được giao nhiệm vụ đi đàm phán hòa giải. Thế nhưng, chẳng may ông ta đã vô tình trở thành thủ phạm, sát hại hai anh em cốt cán của bang phái, và bịa đặt là kẻ giết người vượt ngục trộm xác. Từ đây, Tần Phàm phải chạy trốn, sống trong bóng tối, bị truy đuổi kịch liệt bởi cảnh sát và những tên côn đồ của hai băng phái.

Hơn nữa, Tần Phàm hoàn toàn không nhớ được bản thân đã trốn thoát ra sao, và vì sao lại trở thành kẻ giết người. Mối thù hận và nghi kỵ không ngừng bao trùm lấy cuộc sống của Tần Phàm, khiến anh ta lạc lõng và cô đơn. Để vạch rõ sự thật, chứng minh danh dự và tội danh oan khuất của mình, Tần Phàm phải bắt tay vào cuộc điều tra, tìm kiếm manh mối về cái chết của tên trộm xác và hai anh em kia. Bên trong con người Tần Phàm ẩn chứa một sức mạnh và tài thông minh chưa được khai phá, điều này chính là chìa khóa giúp anh ta vượt qua mọi khó khăn thử thách. Nhưng liệu Tần Phàm có thể tìm được sự thật và thoát khỏi bẫy đen tối của người xấu?

Tân Môn Huyền Án là câu chuyện lịch sử đầy những va chạm, đấu tranh và đẫm máu diễn ra tại bến cảng Tân Môn loạn lạc, lấy bối cảnh những năm đầu của Dân Quốc, thời kỳ rối ren của Trung Hoa. Phim mang đến cho khán giả những thước phim hành động gay cấn, những pha đấu trí lắt léo và đầy bất ngờ, cùng với những âm mưu thâm độc làm cho khán giả hoang mang và tột bậc hồi hộp.